En el marco del presente estudio se desarrolla la evaluación histórica (1997-2003); de la aplicación de beneficios tributarios para la gestión e inversión ambiental en Colombia, con énfasis en las exclusiones de IVA y las deducciones de renta, beneficios que otorgan las normas tributarias vigentes en Colombia. Para ello, se realiza un análisis de los principios tributarios y conceptos involucrados en la normatividad, la reglamentación expedida sobre los procedimientos de acceso a los beneficios, la aplicación de los beneficios desde la perspectiva de contribución al cumplimiento de los objetivos de mejoramiento de la calidad ambiental que desarrollan las políticas sectoriales. Este análisis permite abordar las fallas de gobierno que se han dado en términos de la coordinación de las políticas fiscales y ambientales, en el marco de la línea de trabajo de CEPAL, para realizar una propuesta de mejoramiento de forma que se potencie la aplicación de los beneficios tributarios. Con la evaluación de la base de datos existente sobre beneficios tributarios, se realizó el diseño de un software de captura de esta información y su complemento hacia la generación de indicadores de gestión, resultado e impacto. De esta forma, el estudio aporta un sistema de información actualizado y organizado, en función de una base de datos ajustada y adecuada a las necesidades de manejo de la información requerida por el Ministerio de Ambiente, Vivienda y Desarrollo territorial, para la toma de decisiones. Se trata del primer análisis sobre la dinámica que han tenido los beneficios tributarios en el período 1997-2003, donde se identifican vacíos, se revisan criterios de certificación desde la perspectiva técnico-ambiental, y se formulan recomendaciones y propuestas de carácter reglamentario, técnico y administrativo, orientadas a mejorar la coordinación de las políticas fiscales y ambientales.